Exceso de variantes genéticas raras en genes de riesgo de esclerosis múltiple identificado por resecuenciación de ADN

| PALACIO DE CONGRESOS DE VALENCIA | Hora: 15:30 | Sala: Auditorio 2

 

AUTORES
Gil Varea, Elia 1; Spataro , Nino 2; Fernández Fernández, Oscar 3; Saiz , Albert 4; Ramió Torrentà, Lluis 5; Matesanz , Fuencisla 6; Malhotra , Sunny 7; Navarro , Arcadi 2; Bosch , Elena 2; Montalban Gairín, Xavier 7; Comabella López, Manuel 7


 

CENTROS
1. Servicio: Neuroinmunología Clínica. Hospital Universitari Vall d´Hebron; 2. Servicio: Department of Experimental and Health Sciences. Institute of Evolutionary Biology (CSIC-UPF); 3. Servicio: Neurociencias. Hospital Regional Universitario de Málaga; 4. Servicio de Neurología. Hospital Clínic i Provincial de Barcelona; 5. Servicio: Neuroinmunología Clínica. Hosp. Universitari Dr. Josep Trueta de Girona; 6. Servicio: Dept. Cell Biology and Immunology. Instituto de Parasitología y Biomedicina López Neyra; 7. Servicio: Neuroinmunología Clínica. Hospital Universitari Vall d'Hebron

 

 

TEMÁTICA
La heredabilidad de la esclerosis múltiple (EM) no se explica íntegramente mediante variantes genéticas comunes. Determinadas variantes raras (VR) con frecuencia del alelo minoritario (MAF) <1% podrían explicar parte de la heredabilidad perdida. El objetivo del estudio es la identificación, mediante resecuenciación de ADN, de VR asociadas con la EM de los siguientes genes de riesgo: FCRL1, RGS1, TIMMDC1, HHEX, CXCR5, LTBR, TSFM, GALC, TRAF3, STAT3, TNFSF14, IFI30, CD40 y CYP24A1.

 

OBJETIVOS
Los exones y secuencias reguladoras de los genes seleccionados (~140kb) se secuenciaron con alta cobertura (~85X) mediante la tecnología Illumina Hiseq, con previo enriquecimiento mediante el sistema de arrays Nimblegen, en 1.070 muestras de ADN, 524 de pacientes con EM y 546 de controles sanos.

 

MATERIAL Y MÉTODOS
Se identificaron 1.671 VR, que incluyen 118 SNPs no-sinónimos (89 clasificados como deletéreos), 3 desplazamientos del marco de lectura, 4 stop-gains y 1 stop-loss. En pacientes con EM, se evidenció un enriquecimiento de VR de RGS1 y STAT3, tanto a nivel global como específicamente en regiones reguladoras. Las VR de RGS1 se acumulan particularmente en la región UTR3’. Se observó una acumulación de VR en regiones codificantes de TRAF3 en casos de EM. Sin embargo, sólo el enriquecimiento de VR de RGS1 fue significativo tras la corrección por comparaciones múltiples.

 

RESULTADOS
En pacientes con EM, las VR se acumulan en fragmentos específicos de genes de susceptibilidad a EM. Se está trabajando para analizar el papel funcional de las VR detectadas y comprender la arquitectura genética y la etiología de la EM.

 


 

Dirección

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