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Identificación de genes implicados en la recuperación del ictus isquémico mediante secuenciación del exoma de pacientes con fenotipos extremos

Identificación de genes implicados en la recuperación del ictus isquémico mediante secuenciación del exoma de pacientes con fenotipos extremos

COMUNICACIÓN ORAL | 18 noviembre 2014, martes | Hora: 16:00

AUTORES

Mola Caminal, Marina 1; Rabionet Janssen, Raquel 2; Soriano Tárraga, Carolina 1; Giralt Steinhauer, Eva 1; Carrera , Caty 3; Fernández Cadenas, Israel 4; Estivill , Xavier 2; null, Jaume 1; Jiménez Conde, Jordi 1


CENTROS

1. Servicio de Neurología. Hospital del Mar; 2. Servicio de Genética. Centro de Regulación Genómica; 3. Servicio de Neurología. Hospital Universitari Vall d'Hebron; 4. Servicio de Neurología. Hospital Universitari Mútua de Terrassa

OBJETIVOS

Las enfermedades cerebrovasculares son la principal causa de discapacidad en adultos. La variabilidad en la recuperación funcional después de un accidente cerebrovascular está influenciada por muchos factores. Independientemente de variables clínicas como edad, subtipo etiológico de ictus o estenosis, la variabilidad interindividual en la recuperación neuronal es considerable. Existen muchas vías metabólicas implicadas en la respuesta al daño isquémico cerebral y su actividad puede modularse por variación en los genes que codifican sus componentes. El objetivo del estudio es identificar variantes genéticas, genes y vías que influyen en el proceso de recuperación del ictus.

MATERIAL Y MÉTODOS

Se seleccionaron 81 pacientes con fenotipo extremo (36 mal pronóstico y 45 buen pronóstico) mediante la escala funcional mRS a los 3 meses después del ictus. Los individuos entre grupos fueron apareados por gravedad clínica inicial, nivel funcional basal, edad y sexo, seleccionados de una cohorte de más de 4000 pacientes. Las muestras se sometieron a secuenciación del exoma (Nimblegen v3 y Illumina HiSeq). El análisis de datos consistió en un test de asociación de modelo mixto para identificar genes con acumulación de variantes (ponderadas por frecuencia y Condel Score) en uno de los dos grupos.

RESULTADOS

El análisis proporcionó un conjunto de 410 genes nominalmente significativos (ninguno superó la corrección por hipótesis múltiples) sugerentes de ser relevantes para la recuperación funcional del ictus.

CONCLUSIONES

Para confirmar los resultados, se realizará un análisis de convergencia con un GWAS de 1000 pacientes de ictus adicionales (HumanCoreExome, Illumina) seguido por genotipación targeted y análisis funcionales.

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