Secuenciación del exoma en pacientes con enfermedad de Alzheimer y demencia frontotemporal de inicio precoz: análisis de variantes genéticas en genes de riesgo

COMUNICACIÓN ORAL | 20 noviembre 2018, martes | Hora: 17:30

AUTORES

Lladó Plarrumaní, Albert 1; Sanchez-Valle Diaz, Raquel 1; Falgas Martinez, Neus 1; null, Mircea 1; Datta , Debayan 2; Armengol Dulcet, Lluis 2; Borrego , Sergi 1; Fernandez Villullas, Guadalupe 1; Bosch Capdevila, Beatriz 1; Olives Cladera, Jaume 1; Muñoz Garcia, Cristina 1; León Roman, Maria 1; Castellvi Sampol, Magda 1; Tort Merino, Adria 1; Antonell Boixader, Anna 1


CENTROS

1. Servicio de Neurología. Hospital Clínic i Provincial de Barcelona; 2. Servicio: Esplugues de Llobregat. qGenomics (Quantitative Genomic Medicine Laboratories)

OBJETIVOS

Evaluación del exoma de pacientes con enfermedad de Alzheimer (EA) y demencia frontotemporal (DFT) de inicio precoz (<65 años) para estudiar variantes genéticas en genes de riesgo para demencias neurodegenerativas.

MATERIAL Y MÉTODOS

Se analizaron datos de exoma (profundidad media de 50-75x) de 98 pacientes: 57 con EA confirmada biológicamente (edad inicio 52,9±4,3) y 41 DFT (edad inicio 53,8±7,6). Se descartaron 4 pacientes al detectarse mutación causal (1 EA con mutación PSEN1 y 3 DFT con mutaciones en MAPT, VCP y PRNP). Se analizó la frecuencia de variantes genéticas (incluyendo variantes missense, frameshift, splicing, stopGain) en 5 genes de riesgo para demencia (ABCA7, SORL1, SQSTM1, TREM2 y TMEM106B) y se comparó con la frecuencia encontrada en base de datos gnomAD (123.136 exomas y 15.496 genomas). Se han analizado también las variaciones del número de copias (CNVs) en genes causales y de riesgo en toda la cohorte.

RESULTADOS

Número de variantes genéticas: 22 en ABCA7, 18 en SORL1, 6 en SQSTM1 y 1 en TREM2 entre los pacientes con EA y 10 en ABCA7, 7 en SORL1 y 1 en TREM2 en el grupo de DFT. Estas frecuencias no difieren de las esperadas en la población general. El análisis de CNVs reveló la presencia de una deleción parcial de ABCA7 y 4 genes contiguos (±105kb) en una paciente con DFT (chr19:g.1048865_1154298del).

CONCLUSIONES

La frecuencia de variantes genéticas detectadas en los genes de riesgo estudiados no difiere de las esperadas en la población general. Un estudio individualizado de cada variante será necesario para conocer su posible patogenicidad.

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