COMUNICACIÓN ORAL | 22 noviembre 2012, jueves | Hora: 17:30
AUTORES
Sánchez Juan, Pascual 1; Bishop , Matthew T 2; Brandel , Jean-Philippe 3; Ibrahim-Verbaas , Carla 4; Carracedo , Angel 5; Combarros , Onofre 1; Zerr , Inga 6; Laplanche , Jean-Louis 7; Knight , Richard S.G. 2; Will , Robert G 2; van Duijn , Cornelia M 4
CENTROS
1. Servicio de Neurología. Hospital Universitario Marqués de Valdecilla; 2. Servicio: National CJD Research and Surveillance Unit. University of Edinburgh; 3. Servicio: APHP, Cellule Nationale de Référence des maladies de Creutzfeldt-Jakob. Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière; 4. Servicio: Genetic Epidemiology Unit. Erasmus MC; 5. Grupo de Medicina Xenómica. Universidad de Santiago de Compostela; 6. Servicio: National TSE Reference Center, Department of Neurology. Georg-August University; 7. Servicio: Service de Biochimie et Biologie Moléculaire. Laboratoire associé au CNR“ATNC” Hôpital Lariboisière
OBJETIVOS
Realizamos un estudio de asociación genómica (GWA) con enfermos de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob para encontrar SNPs de riesgo.
MATERIAL Y MÉTODOS
Se realizó un GWA usando el chip Affymetrix 500K en una serie de 93 pacientes con ECJ nueva variante y 463 con ECJ esporádica (117 alemanes, 282 del Reino Unido UK y 64 holandeses). Los casos se compararon con 1504 controles del Reino Unido y 491 holandeses. El análisis de asociación se realizó mediante el programa GenABEL y posteriormente se hizo Pathway analysis mediante ALIGATOR.
RESULTADOS
Como era previsible, los SNP más significativos se encontraron dentro del gen PRNP. Nuestros mejores resultados en ECJ variante fueron replicados en una población independiente de casos británicos y franceses. Ambos SNPs rs4921542 (p=1.6x10-8) y rs7565981 (4,2x10-8) se asocian a dos genes relacionados con la vía del fosfatidilinositol. No encontramos SNPs asociados significativamente a la ECJ esporádica, pero el pathway análisis muestra que la via “anchored to membrane” (GO:0031225) está sobre representada entre los SNPs de riesgo de esta variante.
CONCLUSIONES
Nuestro estudio revela dos nuevos SNPs asociados significativamente al riesgo de padecer variante de la ECJ. Además, implica a la vía del fosfatidilinositol en los mecanismos etiopatogénicos de las enfermedades por priones.
