COMUNICACIÓN ORAL | 21 noviembre 2015, sábado | Hora: 11:00
AUTORES
Fissolo , Nicolas 1; Triviño , Juan Carlos 2; Marco , Guillermo 2; null, Laura 1; null, Sunny 1; Vidal Jordana, Angela 1; Montalban Gairín, Xavier 1; Comabella López, Manuel 1
CENTROS
1. Servicio: Neuroinmunología Clínica. Hospital Universitari Vall d'Hebron; 2. Servicio: Bioinformatics Department. Sistemas Genómicos
OBJETIVOS
Identificar genes asociados con cursos evolutivos benignos y agresivos de esclerosis múltiple (EM) mediante secuenciación de exomas.
MATERIAL Y MÉTODOS
Pacientes de EM con formas de inicio con brotes se clasificaron en base a su curso clínico en fenotipos benignos (n=10; EDSS <=3 tras 15 años o más de evolución de la enfermedad sin haber recibido tratamiento) y agresivos (n=10; EDSS >=6 tras 5 años de evolución de la enfermedad, independientemente del tratamiento recibido). La secuenciación de exomas se realizó con muestras de ADN de pacientes pertenecientes a ambos grupos mediante la tecnología de Illumina (HiSeq2000).
RESULTADOS
En el análisis global de todas las muestras se detectaron 186.706 variantes genéticas, de las cuales 915 fueron significativas (p<=0,05). Para la selección de las variantes más relevantes en la enfermedad, se aplicaron diversos filtrados basados en la odds ratio, prevalencia del fenotipo, número de variantes significativas por gen, y tipo y efecto de las variantes en las proteínas predichas. Tras aplicar estos criterios se ha seleccionado un total de 32 variantes pertenecientes a 28 genes, las cuales se genotiparán en una corte independiente de pacientes con EM clasificados en fenotipos benignos y agresivos en base a los mismos criterios.
CONCLUSIONES
Los genes relacionados con las variantes seleccionadas podrían derivarse en biomarcadores de actividad de la enfermedad para identificar pacientes de EM con diferentes cursos clínicos, y podrían ayudar a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares que participan en la patogenia de la enfermedad.
