Búsqueda de biomarcadores para la esclerosis múltiple mediante secuenciación de ARN, microARN y exomas

COMUNICACIÓN ORAL | 20 noviembre 2015, viernes | Hora: 15:30

AUTORES

Comabella López, Manuel 1; Vallverdú , Meritxell 1; Triviño , Juan Carlos 2; Negrotto , Laura 1; Reinwick , Neil 2; Castilló Justribó, Joaquin 1; Fissolo , Nicolas 1; Malhotra , Sunny 1; Montalban Gairín, Xavier 1


CENTROS

1. Servicio: Neuroinmunología Clínica. Hospital Universitari Vall d'Hebron; 2. Servicio: Bioinformatics Department. Sistemas Genómicos

OBJETIVOS

Identificar biomarcadores de actividad de la enfermedad en pacientes con esclerosis múltiple (EM) mediante abordajes de secuenciación de ARN, microARN y ADN.

MATERIAL Y MÉTODOS

Se obtuvieron células mononucleares de sangre periférica (CMSP) y ADN de 12 controles sanos y 44 pacientes con EM no tratados. El grupo de EM incluyó 10 pacientes con EM remitente-recurrente temprana (EMRR; primeros 5 años de evolución de la enfermedad), 11 pacientes con EMRR benigna (EDSS <=3.0 tras >=15 años de inicio de la enfermedad), 12 pacientes con EM secundariamente progresiva y 11 pacientes con EM primariamente progresiva (EMPP). La secuenciación de ARN y microARN se llevó a cabo en CMSP con la plataforma de secuenciación de Illumina (HiSeq2500). La secuenciación de exomas se realizó a partir de muestras de ADN con la plataforma de Illumina HiSeq2000.

RESULTADOS

Los pacientes con EMRR benigna se caracterizaron por una mayor expresión de HSPA1B, un gen que codifica un miembro de la familia de proteínas de choque térmico 70. Los pacientes con EMPP presentaron una mayor expresión de genes inducidos por NF-κB, en particular IL-1b e IL-6. En pacientes con EMRR, la mayor expresión del microARN 132 (hsa-miR-132) se asoció con una menor expresión de HBEGF (heparin-binding EGF-like), un gen regulado por hsa-miR-132. Todos los resultados mencionados se asociaron con p-valores ajustados <0,05.

CONCLUSIONES

Estos resultados sugieren diferentes mecanismos moleculares subyacentes a las diferentes formas clínicas y cursos evolutivos de EM. Los genes que mostraron mayor expresión diferencial podrían considerarse biomarcadores de actividad de la enfermedad.

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