COMUNICACIÓN ORAL | 17 noviembre 2016, jueves | Hora: 18:00
AUTORES
Alloza Moral, Iraide 1; Goikuria Iriondo, Haize 2; Vega Manrique, Reyes 3; Garcia Barcina , Maria 4; Elizagaray , Elena 5; Montoya , Genoveva 6; Sarasola , Esther 4; Idro , Juan Luis 7; null, Koen 2; Freijo Guerrero, Maria del Mar 7
CENTROS
1. Departamento de Neurociencias. Universidad del País Vasco; 2. Departamento de Neurociencias. Universidad del País Vasco, Departamento de Neurociencias, Neurogenomiks; 3. Servicio: Cirugía Vascular y Angiología. Hospital de Basurto; 4. Servicio de Genética. Hospital de Basurto; 5. Servicio: Radiología. Hospital de Basurto; 6. Servicio: Facultad de Psicología y Educación. Universidad de Deusto; 7. Servicio de Neurología. Hospital de Basurto
OBJETIVOS
La formación de aterosclerosis en la arteria carótida es un factor de riesgo en la enfermedad cerebrovascular. Una comprensión profunda del papel que juega uno de los tipos celulares principales presentes en la placa, células de musculo liso (SMCs), en la desestabilización de la placa de ateroma de la arteria carótida puede ayudar a entender como ocurre la sintomatología de la enfermedad cerebrovascular. Análisis de transcriptómica de SMCs mediante secuenciación masiva son esenciales para profundizar en la comprensión del papel de las SMCs en la aterosclerosis de la arteria carótida.
MATERIAL Y MÉTODOS
Las células SMCs han sido aisladas de placas de ateroma (7 sintomáticas y 7 asintomáticas). El RNA ha sido extraído y purificado seguido de una eliminación del RNA ribosómico. La secuenciación de las librerías preparadas con dicho RNA fueron secuenciadas con la plataforma HiSeq2500 de Illumina. Análisis bioinformaticos han sido usados para la cuantificación genómica, de isoformas, determinación de noveles transcritos, análisis de enriquecimiento funcional.
RESULTADOS
Los resultados del análisis de trancriptómica identifican un panel de mas de 100 isoformas diferencialmente expresadas, así como un lncRNA y varías regiones intrónicas no identificadas previamente en los dos grupos estudiados. El análisis de enriquecimiento funcional ha identificado una serie de factores asociados a varios proceso biológicos.
CONCLUSIONES
Mediante el uso de RNAseq hemos identificado candidatos noveles, y vías que pueden ser instrumentales en la comprensión del papel de las SMCs en la aterosclerosis asintomática y además pueden ayudar a identificar biomarcadores que nos puedan diferenciar los dos grupos.
