COMUNICACIÓN ORAL | 20 noviembre 2019, miércoles | Hora: 15:30
AUTORES
Acha Santamaría, Blanca 1; Blanco Luquin, Idoia 1; Urdanoz Casado, Amaya 1; Sánchez Ruiz de Gordoa, Javier 2; Roldán Arrastia, Miren 1; Labarga , Alberto 3; Vicuña Urriza, Janire 1; Cabello , Carol 1; Zalaya , Maria Victoria 4; Echávarri , Carmen 2; Mendioroz , Maite 1
CENTROS
1. Grupo de Neuroepigenética. Navarrabiomed; 2. Servicio de Neurología. Complejo Hospitalario de Navarra; 3. Unidad de Bioinformática Traslacional.. Navarrabiomed; 4. Servicio de Anatomía Patológica. Complejo Hospitalario de Navarra
OBJETIVOS
Los pacientes con enfermedad de Alzheimer (EA) presentan en el tejido cerebral modificaciones epigenéticas en el patrón de metilación del DNA desde los estadios iniciales. Sin embargo, estas modificaciones tempranas todavía no se han caracterizado en el hipocampo. El objetivo del estudio fue identificar variantes en la metilación del DNA en el hipocampo humano en los estadios tempranos de la EA que puedan servir como potenciales biomarcadores de diagnóstico precoz.
MATERIAL Y MÉTODOS
Se realizó un estudio de metilación del DNA en todo el genoma utilizando la plataforma Infinium HumanMethylation450 BeadChip (Illumina) en muestras postmortem de hipocampo de 26 pacientes con EA pura y 12 controles. Se utilizó la clasificación ABC para determinar el estadio neuropatológico de la EA. Se realizó un análisis ajustado por edad (limma package-R/Bioconductor) para investigar dinucleótidos CpGs que mostraran diferencias en el porcentaje de metilación desde el estadio ABC inicial. Los resultados se validaron mediante pirosecuenciación-bisulfito.
RESULTADOS
Se encontraron 8 CpGs diferencialmente metilados en etapas tempranas de la EA (ABC inicial) (diferencia beta absoluta >= 0.1; p <= 0,05). Entre estos, 4 CpGs localizados en los genes ELOVL2 (p-valor < 0,01), HIST1H3E (p-valor < 0,01), HIST1H4A (p-valor < 0,05) y GIT1 (p-valor 0,01) fueron validados por pirosecuenciación-bisulfito. Estos genes se han relacionado previamente con funciones cerebrales y/o EA.
CONCLUSIONES
Los genes ELOVL2, HIST1H3E, HIST1H4A y GIT1 se identifican como biomarcadores epigenéticos candidatos para ser explorados en el diagnóstico temprano de la EA.
