COMUNICACIÓN ORAL | 22 noviembre 2019, viernes | Hora: 15:30
AUTORES
Alloza Moral, Iraide 1; Freijo Guerrero, Maria del Mar 2; Vega Manrique, Reyes 3; Mena Lucia, Jorge 4; Luna Rodríguez, Alain 2; Asensio García, Ricardo 3; Ovejero Jauregi, Sergio 5; González-Pinto González, Tirso 2; Pérez Concha, Tomas 2; Vandenbroeck Van Caeckenbergh, Koen 6
CENTROS
1. Servicio: Inflammation & Biomarkers. Universidad del País Vasco; 2. Servicio de Neurología. Hospital Universitario de Cruces; 3. Servicio: Cirugía Vascular. Hospital de Basurto; 4. Servicio: Neurogenomiks. Universiad del País Vasco; 5. Servicio: Neurogenomiks. Unviersidad del País Vasco; 6. Servicio: Neurogenomiks. Universidad del País Vasco
OBJETIVOS
La formación de aterosclerosis en la arteria carótida es un factor de riesgo en la enfermedad cerebrovascular (ACV). Una comprensión profunda del papel que juega uno de los tipos celulares principales presentes en la placa, células de musculo liso (SMCs), puede ayudar a entender el proceso que tiene lugar en la desestabilización de la placa de ateroma. Nuestro objetivo es analizar el perfil de transcriptómica en las SMC para identificar biomarcadores de dicha desestabilización.
MATERIAL Y MÉTODOS
Se ha realizado un análisis de SNPs/eQTLs de los datos de RNAseq. DNA de 300 muestras ha sido extraído y cuantificado. Los SNPs seleccionados han sido validados utilizando la plataforma de PCRdigital Fluidigm.
RESULTADOS
El análisis bioinformático de los datos obtenidos mediante RNAseq han identificado un amplio listado de más de 100 SNPs asociados con la inestabilidad. 12 de estos SNPs han sido analizados en un cohorte de 300 muestras de pacientes con placas estables e inestables. Hemos determinado que uno de los 12 SNP, que se encuentra el gen BIRC6, muestra una asociación con la inestabilidad de la placa con un valor p de 0.004.
CONCLUSIONES
Hemos demostrado que mediante el uso de RNAseq, análisis bioinformáticos y PCRdigital se pueden identificar biomarcadores (i.e. SNP) con valor pronóstico del riesgo de desarrollar una placa de ateroma inestable en la arteria carótida.
