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Estudio del transcriptoma de la corteza motora de pacientes con ELA mediante secuenciación masiva de ARN

Estudio del transcriptoma de la corteza motora de pacientes con ELA mediante secuenciación masiva de ARN

COMUNICACIÓN ORAL | 22 noviembre 2019, viernes | Hora: 17:30

AUTORES

Dols- Icardo, Oriol 1; Montal , Victor 2; Sirisi , Sonia 2; López- Pernas, Gema 2; Molina- Porcel, Laura 3; Muñoz- Llahuna, Laia 2; Cervera- Carles, Laura 2; Turón- Sans, Janina 4; Fortea , Juan 2; Blesa , Rafael 2; Lleó , Alberto 2; Rojas- García, Ricard 4; Clarimón , Jordi 2


CENTROS

1. Unidad de Memoria. Servicio de Neurología. Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau. Hospital de la Santa Creu i Sant Pau. CIBERNED; 2. Neurología. Unidad de Memoria. Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau. CIBERNED.; 3. Servicio de Neurología. Banco de Tejidos Neurológicos del Biobanc-Hospital Clínic-IDIBAPS; 4. Neurología. Unidad de Enfermedades Neuromusculares. Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau. CIBERNED.

OBJETIVOS

La alteración en el metabolismo del ARN es un proceso clave en la patología asociada a la ELA. A pesar de esto, ningún estudio ha investigado de forma exhaustiva las posibles alteraciones del ARN en la corteza motora de casos con ELA, utilizando secuenciación masiva del ARN.

MATERIAL Y MÉTODOS

Se aisló el ARN de la corteza motora de once casos con ELA y ocho individuos sanos sin cambios neuropatológicos en esta región cerebral. La preparación de las librerías se realizó mediante el kit TrueSeq Stranded Total RNA (Illumina). Se estudiaron las alteraciones en la expresión génica, el uso diferencial de isoformas y los eventos de splicing alternativo. Posteriormente, mediante el uso de datos públicos de ARN aislado de células individuales de cerebro adulto humano, se deconvolucionaron los diferentes tipos celulares y se estudiaron las alteraciones del ARN específicas para cada tipo celular.

RESULTADOS

Se evaluaron un total de 24.738 genes y 147.711 tránscritos. Entre ellos, 124 genes y 64 tránscritos resultaron significativamente alterados. La deconvolución celular demostró un aumento en la proporción de células microgliales y un recuento disminuido de una subpoblación neuronal gabaérgica y glutamatérgica en la corteza motora de los pacientes, así como alteraciones significativas en la expresión génica según el tipo celular.

CONCLUSIONES

Nuestros datos proporcionan evidencia de que la homeostasis del ARN se halla alterada en la ELA. Finalmente, demostramos alteraciones en la composición celular y cambios transcripcionales específicos de cada tipo celular en la corteza motora de pacientes con ELA.

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