COMUNICACIÓN ORAL | 23 noviembre 2020, lunes | Hora: 15:00
AUTORES
Ramos Campoy, Oscar 1; Llado Plarrumani, Albert 1; Bosch , Beatriz 1; Aldecoa , Iban 2; Gonzalo , Ricardo 3; Muñoz , Cristina 1; Vergara , Miguel 1; Ximelis , Teresa 4; Fernandez Villullas, Guadalupe 1; Balasa , Mircea 1; Sanchez Pla, Alex 5; Sanchez-Valle , Raquel 1; Antonell Boixader, Anna 1
CENTROS
1. Servicio de Neurología. Hospital Clínic i Provincial de Barcelona; 2. Servicio: Anatomia patologica. Hospital Clínic i Provincial de Barcelona; 3. Servicio: Unitat d'estadistica i bioinformatica. Institut de Recerca Vall d'Hebrón; 4. Servicio: Banc de Teixits Neurologics. IDIBAPS; 5. Servicio: Unitat d'estadistica i bioinformatica. Insitut de Recerca Vall d'Hebron
OBJETIVOS
Estudiar la expresión génica, a nivel del genoma completo, y sus diferencias entre la enfermedad de Alzheimer causada por mutación en el gen PSEN1 (PSEN1), la esporádica de inicio precoz (EAIP) y un grupo control (CTRL), en dos tipos de muestras: córtex cerebral post mortem y líneas celulares linfoblastoides (LCL).
MATERIAL Y MÉTODOS
Análisis de expresión génica mediante el microarray Clariom D (Affymetrix) de muestras de córtex prefrontal congelado (n=13; 5 CTRL, 4 EAIP, 4 PSEN1) y LCL (n=15; 5 CTRL, 5 EAIP, 5 PSEN1). Los genes diferencialmente expresados (GDE) se han obtenido mediante un ajuste lineal con moderación bayesiana de la varianza, partiendo del 35% de genes más variables. Posteriormente se ha realizado un Gene Set Enrichment Analysis para hallar el significado biológico de los GDE en cada comparación.
RESULTADOS
GDE (córtex/LCL): EAIP vs CTRL (781/355), PSEN1 vs CTRL (503/275) y PSEN1 vs EAIP (244/115). Las vías biológicas enriquecidas en todas las comparaciones y tejidos son las implicadas en transducción de señales y sistema inmune. Además, existen vías de tipo metabólico y splicing en los dos grupos de pacientes en comparación a controles, así como vías de tipo sináptico en LCL (todas las comparaciones) y en córtex (EAIP vs CTRL).
CONCLUSIONES
Se encuentran más GDE en tejido cerebral que en LCL. Las vías diferencialmente expresadas entre EAIP y PSEN1 son las implicadas en sistema inmune y transducción de señales (cerebro y LCL) y vías sinápticas (sólo en LCL). Será necesario validar estos resultados mediante qPCR para descartar falsos positivos.
